Fundada oficialmente em 2012, a equipa B é um pilar fundamental da estratégia formativa e desportiva do Vitória Sport Clube, assumindo um papel importante na transição entre os escalões de formação e os mais altos patamares competitivos.

Na época 2012/13, o Vitória Sport Clube ‘B’ estreou-se na II Liga e registou a maior afluência de espectadores entre todas as equipas da competição. Entre 2014/15 e 2018/19, competiu no segundo escalão do futebol nacional, sendo despromovido em 2019 ao Campeonato de Portugal. Foi integrado na Liga 3 em 2021/22, época inaugural da competição promovida pela FPF, sendo despromovido novamente em 2023/24. Duas temporadas depois, a equipa B alcançou a subida de escalão, disputando inclusivamente a final do Campeonato de Portugal no Estádio Nacional e assegurando a presença na Liga 3 na época 2025/26.

Pela equipa B do Vitória Sport Clube já passaram algumas referências do futebol nacional e internacional. Entre outros, destacam-se Raphinha, jogador do FC Barcelona, duas vezes vencedor da La Liga e melhor marcador da Champions League em 2024/25; Ricardo Pereira, marcador do golo que consagrou o Vitória SC como vencedor da Taça de Portugal em 2012/13, vencedor de uma Liga Portugal e um nome indiscutível do Leicester City, clube com o qual venceu a FA Cup, o Championship e a Community Shield; e Edmond Tapsoba, que se transferiu da Cidade Berço para o Bayer Leverkusen, vencendo a Bundesliga, a Supertaça da Alemanha e a Taça da Alemanha.